渐渐走到研究所深处，白枫似乎看出了这是一个什么性质的研究所，他们研究的项目应该和天气有关。
不过很快他就不这么想了。
走到研究所的更深处，在聒噪鸟的提醒下，白枫找到了一个暗门，里面似乎隐藏着秘密。
白枫疑惑地看向聒噪鸟：“你怎么知道这么多，你该不会和幽灵系宝可梦们是一伙儿的吧？”
“呱~呱~”不是，不是。
聒噪鸟闻言赶紧摇头否认。
那就是和研究所有关系了！白枫默默在心里想道。
走进暗门之后，出现在白枫和白叶面前的是一条长长的白色走廊，他一进去，走廊天花板上的灯就哗哗哗全亮了起来。
大概是因为这里太亮了吧，白枫一路走过去，竟然没有受到幽灵系宝可梦的攻击。
穿过白色走廊，白枫面前再次出现一道门，这门是自动的，白枫和白叶一靠近，它就自动打开。
门打开的一瞬间，门内突然亮起一双双猩红的眼睛，全都直勾勾地盯着白枫和白叶，把母子俩着实吓了一跳。
这些眼睛有的是幽灵系宝可梦的，有的则不是，幽灵系宝可梦都自由自在地飘荡在房间里，而非幽灵系宝可梦们则全部被关在一个个铁笼里。
铁笼里的宝可梦状态非常不正常，它们看上去非常暴躁，并且在不断的攻击铁笼，嘴里发出声声嘶吼和呻吟。
而幽灵系宝可梦们似乎是在看守它们。
不过……这些宝可梦的状态看着怎么那么眼熟呢？白枫不由自主地想到了袭击罗布叔叔家牧场的龙头地鼠，还有那给比翼市造成重大伤亡的巨炭山和大钢蛇。
太像了！
看守的幽灵系宝可梦在发现有外人到来后，立马将白枫和白叶包围起来，只是它们实力太弱，很快便被和白枫建立了精神力链接的白叶给打败了。
白枫走进房间，在房间里转了一圈之后，在这里发现了一台电脑，从上面记载的信息中，他终于找到了这个研究所的秘密。
这原本的确是一家天气研究所，而且还是官方设置在这里，为往来的船只提供帮助的地方。
大概是因为这个地方位置隐蔽，半年前，一伙人悄悄占据了这里，并将这里改造成了黑暗实验基地。
研究所原本的工作人员在这伙人的威胁下，渐渐的和他们同流合污，最终和他们一起参与了黑暗研究，并为他们的实验提供掩护。
他们一直在研究一种药物，这种药物能激发宝可梦体内最原始的野性，让它们实力大增。
但这药物同时也有一个负面影响，那就是注射药物之后，宝可梦的心智会受到极大影响，大部分都会陷入癫狂。
只有少部分天赋异禀的宝可梦，在注射了药物之后，不仅没有失去理智，还变得凶猛强悍。
他们实验的目的就是为了找出更多这样的宝可梦。